Données produites depuis 2021 dans le cadre de l'OTHU pour le suivi des paramètres météorologiques. Station météo:Campbell SCI CR1000. Paramètres suivis: température, humidité de l'air, ensoleillement, vitesse et orientation du vent et pluviométrie.

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données physicochimiques sur des sédiments urbains (pH, poids sec, ions, éléments traces métallique, N, P, Hydrocarbure aromatique polycyclique) échantillonnés sur 9 zones de la métropole de Lyon (avec 3 typologies) pendant 3 saisons. Ces données sont associées à d'autres concernant la qualité microbiologique de ces sédiments via qPCR des ADN avec les marqueurs de la trousse OTHU. Ces données sont complétées par des images produites par microscopie électronique à balayage des microorganismes présents. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (paramètres généraux, pH, Chimie, ADN, quantification qPCR) - CONTEXTE : L'étude des sédiments urbains en terme microbiologique et physicochimiques permets de faire le lien entre chimie et présence de microorganismes, et en particulier de pathogènes. Ces données sont associés à des images de microscopie électronique à balayage pour visualiser la diversité des formes microbiennes et les rendre accessibles au publique. Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des sédiments urbains remobilisés par temps de pluie au niveau de la métropole. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEU : métropole de Lyon - PÉRIODE : novembre 2023 à juin 2024

Incubation de supports artificiels (billes d'argile) pour échantillonner les microorganismes dans la nappe sur 2 sites en amont et aval de bassins d'infiltration (Django-Reinhardt et l'IUT) Campagne de collectes d'eau et de substrats artificiels (billes d'argile) lors de l'incubation (7 temps pour les eaux et 5 temps pour les supports artificiels) Mesures réalisées: - Dynamique des nutriments (NO3, NH4, PO4) du carbone organique dissous total et biodégradable - Dynamique structurelle des communautés bactériennes : analyses de métabarcoding 16S - Dynamique fonctionnelle des communautés microbiennes : activités microbiennes (hydrolytique FDA et respiratoire INT)

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants au sein d'un déversoir d'orage d'un bassin versant résidentiel. Autosurveillance pour la Métropole de Lyon. Paramètres hydrauliques: débits (Hauteurs/vitesses), pluviométrie (2004 à 2019) Paramètres physico-chimiques: conductivité électrique, température, pH, turbidité (2004 à 2012)

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'entrée d'un bassin d'infiltration. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)

- DESCRIPTION Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron. Différents modes d’utilisation des terres ont été répertoriés et 10 sous-bassins homogènes en terme d’activité et d'occupation des sols ont été sélectionnés pour les analyses des sources de contamination. Plusieurs campagnes de récolte d'eaux aux différentes sources ont été réalisées (10/02/22, 15/02/22, 17/05/22, 27/06/22 et 30/06/22) - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement étudiés - CONTEXTE Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales - BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?) Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - LIEU Bassin versant emboité Mercier-Ratier. 10 sous-bassins homogènes en terme d’activité et d'occupation des sols ont été sélectionnés. - PÉRIODE Campagnes 10/02/2022 (temps sec), 15/02/2022 (temps de pluie), 17/05/2022, 27/06/2022 et 30/06/2022.

données issues de travaux spécifiques réalisés sur le sous-bassin rural du Mercier, dans le cadre de la thèse de B. Sarrazin (2012)

Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm

Campagne de collectes de sédiments sur plusieurs bassins d'infiltration de la métropole Mesures des quantité de microplastiques dans les matrices sédimentaires Evaluation en laboratoire de l'impact des micro-plastiques sur un organisme sentinelle aquatique vivant dans les sédiments (le vers tubificidé Tubifex tubifex) 1ère expérimentation : Montage de 40 mésocosmes de 2 litres pour tester 4 concentrations en microplastiques (0, 1000, 10000 et 100000 particules par kg de sédiment sec) et deux conditions biologique (avec ou sans vers tubificidés) Mesures réalisées : Analyse des réserves énergétiques chez les organismes Mesures sur la dynamique des nutriments (NO3, NH4, PO4) et des flux de CO2 émis par les sédiments dans les mésocosmes Mesures des activités microbiennes (hydrolytique FDA et respiratoire INT) Mesures de la bioturbation (dépôt de pelotes fécales à la surface des sédiments) 2ème expérimentation : Montage de 20 colonnes sédimentaires de 1 litres pour tester 2 concentrations en microplastiques (0 et 10000 particules par kg de sédiment sec) et deux conditions biologique (avec ou sans vers tubificidés) Utilisation de luminophores (particules roses fluorescente sous lumière UV) déposés à la surface des sédiments pour quantifier le processus de bioturbation (remaniement des sédiments) dans les différentes colonnes Démontage des colonnes par couches sédimentaires de 0.5 cm pour mesurer la distribution verticale des luminophores en fin d'expérimentation (28 jours). Comptage des luminophores et modélisation du processus de bioturbation par les organismes

Evaluation des performances hydrauliques de techniques alternatives (parking asphalté, chaussée poreuse, noue, tranchée) Paramètres hydrauliques: débits (augets, électromagnétiques) depuis 2017 Paramètres physico-chimiques: Température et conductivité électrique de 2017 à juin 2019